Centrum Archeologii Śródziemnomorskiej UW współpracuje z rządowymi służbami ds. ochrony zabytków w krajach, gdzie prowadzi projekty terenowe. W Egipcie i w Sudanie reprezentują je placówki: Stacja Badawcza CAŚ UW w Kairze (od 1959 r.) i Polski Ośrodek Archeologiczny w Chartumie (od 2018 r.).
Służby ds. ochrony zabytków:
- Ministerstwo Starożytności Egiptu
Ministry of State for Antiquities of the Arab Republic of Egypt - Narodowa Korporacja Starożytności i Muzeów Sudanu
National Corporation of Antiquities and Museums of Sudan - Departament Starożytności Cypru
Department of Antiquities of Cyprus - Dyrekcja Generalna Starożytności i Muzeów Syrii
Direction Générale des Antiquités et Museums - Dyrekcja Generalna Starożytności Libanu
Direction Générale des Antiquités of Lebanon - Narodowa Rada Kultury i Sztuk Pięknych Kuwejtu
National Council for Culture, Arts and Letters of the State of Kuwait - Departament Starożytności Jordanii
Department of Antiquities of Jordan - Saudyjska Komisja ds. Turystyki i Dziedzictwa Narodowego
Saudi Commission for Tourism and National Heritage - Służba ds. Ochrony Dziedzictwa Kulturowego i Muzeów, Ministerstwo Kultury Republiki Armenii
Service for the Protection of Historical Environment and Cultural-Museum Reservations, Ministry of Culture of the Republic of Armenia - Ministerstwo Dziedzictwa Narodowego i Kultury, Sułtanat Omanu
Ministry of National Heritage and Culture, Sultanate of Oman - Narodowy Instytut Dziedzictwa, Tunezja
Institut National du Patrimoine, Tunis
Partnerzy krajowi:
- Ministerstwo Edukacji i Nauki
- Ministerstwo Spraw Zagranicznych
Instytucje współpracujące w kraju:
- Akademia Górniczo-Hutnicza w Krakowie
- Akademia Sztuk Pięknych w Warszawie
- Fundacja Artibus Mundi
- Fundacja Kazimierza Michałowskiego
- Fundacja Ochrony Zabytków, Gdańsk
- Instytut Archeologii i Etnologii Polskiej Akademii Nauk
- Instytut Archeologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie
- Wydział Archeologii Uniwersytetu Warszawskiego
- Instytut Kultur Śródziemnomorskich i Orientalnych Polskiej Akademii Nauk
- Muzeum Archeologiczne w Krakowie
- Muzeum Archeologiczne w Poznaniu
- Muzeum Narodowe w Warszawie
- Państwowe Muzeum Archeologiczne w Warszawie
- Politechnika Warszawska
- Politechnika Wrocławska
- Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
- Zakład Egiptologii, Wydział Orientalistyczny Uniwersytet Warszawski
Instytucje współpracujące za granicą:
- Francuski Instytut Archeologiczny w Kairze
- Qatar-Sudan Archaeological Project
- The British Museum
- Uniwersytet Stanu Delaware, Stany Zjednoczone